"Dr. Fridtjof Nansen" ble bygget i 1993 og er det andre havforskningsfartøyet med dette navnet. Det er oppkalt etter Fridtjof Nansen (1861-1930), kjent for både havforskning og internasjonalt hjelpearbeid.

I 1985 ble FTFIs båt "Kystfangst" overført til Havforskningsinstituttet og stasjonert i Flødevigen. Den ble omdøpt til "G.M. Dannevig" til ære for grunnleggeren av Forskningsstasjonen Flødevigen, Gunder Mathiesen Dannevig (1841-1911).

"G.O. Sars" er oppkalt etter vår første havforsker, Georg Ossian Sars (1837-1927), og er Havforskningsinstituttets tredje fartøy med dette navnet.

Håkon Mosby" er oppkalt etter Håkon Mosby (1903-1989), en sentral person innen oppbygging og organisering av oseanografisk forskning både nasjonalt og internasjonalt.

"Johan Hjort" er den fjerde i rekken av forskningsfartøy med dette navnet, og er oppkalt etter instituttets første direktør Johan Hjort (1869-1948).