Elin Sørhus

Postdoktor
Telefon: 95240889
Avdeling: Miljøkjemi

Arbeidsområde

I den siste tiden har jeg i hovedsag fortsatt mitt arbeid fra doktorgraden, hvor jeg ser på effekten av oljeforurensing på tidlige livsstadier av både hyse og torsk. Målet er å gå dypere ned i mekanismene bak deformitetene vi observerer i disse artene. I tillegg jobber jeg i et prosjekt som studerer kjønnsmodning i laks. Her har jeg et spesielt fokus på vgll3 , et gen involvert i modningsalder hos laks.

Curriculum Vitae

Utdannelse:

2013-2015. UiO, PhD i molekylærbiologi og økotoksikologi.

I doktorgraden: "Crude oil and its high toxic effect on early life stages of Atlantic haddock -  to the heart of the problem" så jeg på effekten av oljeforurensing på tidlige livsstadier av hyse. Effektene ble studert ved å fenotypisk bestemme abnormaliteter, samt å se på avvik i genuttrykk i de eksponerte gruppene ved bruk av ulike molekylærbiologske metoder. Ved å se genuttrykk og fenotype i sammenheng, foreslår jeg i oppgaven de molekylære mekanismene bak ulike deformiteter, som underutviklet hjerte, observert i hyse.

2002-2005. UiB, Master i molekylærbiologi

I master oppgave: "Studies on minispectrins: Expression in E. coli, purification and in vitro interaction studies" studerte jeg en miniversjon av spektrin, også kalt minispektrin. Jeg lagde en modifisert utgave a proteinet, uten en spesifikk N-terminal hale. Dette ble gjort for å strukturelle og funksjonelle egenskaper til de to versjonene av minispektrin. Kloning, transformering av E.coli celler, uttrykk av protein i E. coli , protein rensing, analyse av makromolekylære interaksjoner var metoder som ble brukt i masterstudiet.

1999-2002. HiB, avd. ingeniør. Bioingeniørutdanning

Arbeidserfaring:

2013- 2015. CEES-UiO/VISTA/IMR. Doktorgradsstipendiat (arbeidssted Bergen)

2005-2012. Overingeniør ved Havforskningsinstituttet i Bergen (IMR)

2005. Avdelingsingeniør ved Høyteknologisenteret i Bergen

1999-2004. Sommerjobb som bioingenør/bioingeniør assistent

I doktorgradssprosjektet "Assessment of the long-term effects of oil exposure on early life stages of haddock using transcriptomics and fitness observations" har jeg arbeidet med embryo og larve av Atlanterhavshyse. I prosjektet har jeg utført innsamling av materiale, bilde- og videotakning av embryo og larver, bilde- og videoanalyse, utført molekylærbiologiske metoder for å studere genuttrykk, deriblant Real time RT PCR, in situ hybridisering og har analysert transkriptomdata.

På havforskningsinstiuttet har jeg jobbet i to forskningsgrupper, Reproduksjon og vekst og Helse gruppen. I mitt arbeid i Reproduksjon og vekst har jeg detektert genuttrykk av ulike hormoner og reseptorer involvert i sex differensiering og modning i laks og torsk. I helsegruppen var jeg involvert i studier angående NODA infeksjon på torsk og kveite, og studier på karakterisering av immunssytem i kveite.

Metoder brukt i mitt arbeid ved IMR har vært RNA isolering, protein og RNA isoleringssystem, cDNA syntese etterfult av PCR eller RT-RTPCR, sekvensering, western blotting, immun histokjemi, in situ hybridisering og noe microarray. Har også vært invovlert i sampling og disseksjon av fisk.

På høyteknologisenteret fortsatte jeg arbeidet på minispektrin-studiet

Publikasjoner

Vitenskapelige artikler (NVI)

2018

Genomic architecture of haddock (Melanogrammus aeglefinus) shows expansions of innate immune genes and short tandem repeats

Ole K. Tørresen, Marine Servane Brieuc, Monica Hongrø Solbakken, Elin Sørhus, Alexander Johan Nederbragt, Kjetill Sigurd Jakobsen, Sonnich Meier, Rolf Edvardsen, Sissel Jentoft
BMC Genomics 19 p. 1-17
2018

Vgll3 and the Hippo pathway are regulated in Sertoli cells upon entry and during puberty in Atlantic salmon testis

Erik Nordtorp Kjærner-Semb, Fernando Ayllon, Lene Kleppe, Elin Sørhus, Kai Ove Skaftnesmo, Tomasz Furmanek, Frida Thyri Segafredo, Anders Thorsen, Per Gunnar Fjelldal, Tom Johnny Hansen, Geir Lasse Taranger, Eva Andersson, Rüdiger W. Schulz, Anna Wargelius, Rolf Edvardsen
Scientific Reports 8:1912 p. 1-11
2017

Oil droplet fouling and differential toxicokinetics of polycyclic aromatic hydrocarbons in embryos of Atlantic haddock and cod

Lisbet Sørensen, Elin Sørhus, Trond Nordtug, John P. Incardona, Tiffany Linbo, Laura Giovanetti, Ørjan Karlsen, Sonnich Meier
PLoS ONE 12:e0180048 p. 1-26
2017

Novel adverse outcome pathways revealed by chemical genetics in a developing marine fish

Elin Sørhus, John P. Incardona, Tomasz Furmanek, Giles W. Goetz, Nathaniel Scholz, Sonnich Meier, Rolf Edvardsen, Sissel Jentoft
eLIFE 6:e20707 p. 1-30
2016

Developmental transcriptomics in Atlantic haddock: Illuminating pattern formation and organogenesis in non-model vertebrates

Elin Sørhus, John P. Incardona, Tomasz Furmanek, Sissel Jentoft, Sonnich Meier, Rolf Edvardsen
Developmental Biology 411 p. 301-313
2016

Crude oil exposures reveal roles for intracellular calcium cycling in haddock craniofacial and cardiac development

Elin Sørhus, John P. Incardona, Ørjan Karlsen, Tiffany Linbo, Lisbet Sørensen, Trond Nordtug, Terje van der Meeren, Anders Thorsen, Maja Thorbjørnsen, Sissel Jentoft, Rolf Edvardsen, Sonnich Meier
Scientific Reports 6 p. 1-21
2015

Unexpected interaction with dispersed crude oil droplets drives severe toxicity in atlantic haddock embryos

Elin Sørhus, Rolf Edvardsen, Ørjan Karlsen, Trond Nordtug, Terje van der Meeren, Anders Thorsen, Christopher Peter Harman, Sissel Jentoft, Sonnich Meier
PLoS ONE 10:e0124376 p. 1-21
2012

Sex differentiation in Atlantic cod (Gadus morhua L.): morphological and gene expression studies

Trine Haugen, Fernanda F.L. Almeida, Eva Andersson, Jan Bogerd, Rune Male, Katrine Sandnes Skaar, Rüdiger W. Schulz, Elin Sørhus, Tim Wijgerde, Geir Lasse Taranger
Reproductive Biology and Endocrinology 10:47

Informasjonsmateriale

2017

Using RNA sequencing to understand real-world embryos

Sørhus, Elin

Poster

2018

PW-Exposed: Produced water fractionation and advanced chemical and toxicological characterization using sensitive life stages of marine fish species

Bjørn Henrik Hansen, Lisbet Sørensen, Elin Sørhus, Julia Farkas, Trond Røvik Størseth, Ida Beathe Øverjordet, Trond Nordtug, Liv Guri Faksness, Andy Booth, Odd Andre Karlsen, Anders Goksøyr, Steven J Rowland, Holly A. Shiels, John P. Incardona, Jörn Kalinowski, Dag Altin, Elin Kjørsvik, Augustine Arukwe, Sonnich Meier

Populærvitenskapelige artikler

2015

Hyse rammes hardt av olje

Elin Sørhus, Rolf Edvardsen, Sonnich Meier
Aftenposten Viten
2015

Klebrig eggeskall gjør hyseegg svært sårbare for oljeforurensning

Sonnich Meier, Elin Sørhus, Ørjan Karlsen, Anders Thorsen, Rolf Edvardsen, Terje van der Meeren, Frode Bendiksen Vikebø
Fisken og Havet, Særnummer 1 p. 64-66

Faglige foredrag

2018

RNA-Seq reveals novel impacts of PAHs on excitation-transcription coupling in cardiomyocytes

Elin Sørhus, Sonnich Meier, John P. Incardona, Rolf Edvardsen, Tomasz Furmanek
2018

Feilutvikling hos fiskelarver ved oljeforurensing

Sørhus, Elin
2017

RNA-Seq reveals novel impacts of PAHs on excitation-transcription coupling in cardiomyocytes

Elin Sørhus, Sonnich Meier, John P. Incardona, Edvardsen Rolf, Nathaniel Scholz, Sissel Jentoft, Giles W Goetz, Tomasz Furmanek
2017

Application of gas chromatography/tandem mass spectrometry to determine a wide range of petrogenic polycyclic aromatic hydrocarbons in small samples of oil exposed fish egg

Lisbet Sørensen, Elin Sørhus, Trond Nordtug, John P. Incardona, Tiffany Linbo, Laura Giovanetti, Marta S. Silva, Svein Are Mjøs, Ørjan Karlsen, Sonnich Meier
2017

DNA damage in Atlantic haddock exposed to sediment or produced water associated PAHs

Sonnich Meier, Ørjan Karlsen, Jérémie Le Goff, Lisbet Sørensen, Elin Sørhus, Daniela Maria Pampanin, Marta Romano, Bjørn Einar Grøsvik
2017

Oil droplet fouling and differential PAH toxicokinetics in embryos of Atlantic haddock and cod.

Lisbet Sørensen, Elin Sørhus, Trond Nordtug, John P. Incardona, Tiffany Linbo, Laura Giovanetti, Ørjan Karlsen, Sonnich Meier
2016

Adaptive plasticity in Atlantic salmon- genetic predisposition of time at maturity and environmental triggers

Rolf Edvardsen, Erik Nordtorp Kjærner-Semb, Fernando Ayllon, Tomasz Furmanek, Tom Johnny Hansen, Per Gunnar Fjelldal, Carl Johan Rubin, Lene Kleppe, Kai Ove Skaftnesmo, Elin Sørhus, Faezeh Mohammadi, Geir Dahle, Vidar Wennevik, Monica Favnebøe Solberg, Kevin Glover, Birgitta Norberg, Geir Lasse Taranger, Eva Andersson, Rüdiger W. Schulz, Anna Wargelius
2016

Transcriptomics identifies novel adverse outcome pathways from crude oil exposure in haddock early life history stages

Elin Sørhus, John P. Incardona, Tomasz Furmanek, Nathaniel Scholz, Sonnich Meier, Sissel Jentoft, Rolf Edvardsen
2016

Fleshing out crude oil cardiotoxicity adverse outcome pathways with transcriptomics in Atlantic haddock embryos

Elin Sørhus, John P. Incardona, Tiffany Linbo, Lisbet Sørensen, Trond Nordtug, Terje van der Meeren, Anders Thorsen, Sissel Jentoft, Rolf Edvardsen, Sonnich Meier
2015

Linking mechanisms of PAH cardiotoxicity, morphogenetic defects and cardiac gene expression in atlantic haddock

Elin Sørhus, Rolf Edvardsen, Ørjan Karlsen, Lisbet Sørensen, Trond Nordtug, Terje van der Meeren, Anders Thorsen, Sissel Jentoft, John Incardona, Frode Bendiksen Vikebø, Maja Thorbjørnsen, Sonnich Meier
2015

Interaction with dispersed crude oil droplets drives severe toxicity and delayed mortality in Atlantic haddock embryos.

Sonnich Meier, Elin Sørhus, Lisbet Sørensen, Anders Thorsen, Trond Nordtug, John Incardona, Frode Bendiksen Vikebø, Terje van der Meeren, Maja Thorbjørnsen, Ørjan Karlsen
2014

Interactions between pelagic fish embryos and dispersed oil droplets

Elin Sørhus, Sonnich Meier, Anders Thorsen, Rolf Edvardsen, Sissel Jentoft, Trond Nordtug, Domagoj Maksan, Maja Thorbjørnsen, Christopher Peter Harman, Terje van der Meeren, Ørjan Karlsen
2014

Interaction between pelagic fish embryos and dispersed oil droplets

Elin Sørhus, Rolf Edvardsen, Ørjan Karlsen, Trond Nordtug, Terje van der Meeren, Anders Thorsen, Domagoj Maksan, Maja Thorbjørnsen, Christopher Peter Harman, Sissel Jentoft, Sonnich Meier
2014

Transkriptomanalyse av atlantisk torsk - mekanismer for rask vekst

Rolf Edvardsen, Tomasz Furmanek, Teshome Bizauyehu, Igor Babiak, Matilde Skogen Chauton, Kai Kristoffer Lie, Ann-Elise Olderbakk Jordal, Elin Sørhus, Ørjan Karlsen, Terje van der Meeren, Anders Mangor-Jensen, Ivar Rønnestad
2013

Assessment of the long-term effects of oil exposure on early life stages of haddock using transcriptomics and fitness observations

Sørhus, Elin
2013

GLOBAL AND LOCAL METHYLATION PATTERN IN TRIPLOID AND DIPLOID AND TRIPLOID ATLANTIC SALMON

Anna Wargelius, Tomasz Furmanek, Rolf Edvardsen, Elin Sørhus, Per Gunnar Fjelldal, Tom Johnny Hansen
2013

TRANSCRIPTOMIC ANALYSIS OF DEVELOPING ATLANTIC COD - UNDERSTANDING THE MECHANISMS UNDERLYING HIGH GROWTH

Rolf Edvardsen, Tomasz Furmanek, Kai Kristoffer Lie, Ann-Elise Olderbakk Jordal, Elin Sørhus, Ørjan Karlsen, Terje van der Meeren, Anders Mangor-Jensen, Ivar Rønnestad
2009

B and T cell markers during Atlantic halibut (Hippoglossus hippoglossus) ontogenesis

Sonal Patel, Aina-Cathrine Øvergård, Elin Sørhus, Ingrid Uglenes Fiksdal, Audun H. Nerland

Annet tidsskriftbidrag

2016

Økonomisk høstbare fiskeressurser. Debattinnlegg om utnytting av petroleumsressurser i Lofoten og Vesterålen

Svein Sundby, Elin Sørhus, Frode Bendiksen Vikebø
iTromsø p. 37
Er denne profilen din? Rediger denne profilen (logg inn)