Fem fartøyer deltar på økosystemtoktet 2005. To av disse tilhører vårt russiske søsterinstitutt PINRO i Murmansk, mens de andre er norske. 

FF. G. O. Sars

FF G.O. Sars

Byggeår: 2001-2003
Størrelse: 4067 grt., 77,5 m
Eier: Havforskingsinstituttet og Universitetet i Bergen
~ nettside om FF. G.O. Sars

Toktleder

06.08 – 24.08: Sondre Aanes
24.08 –  12.09: Erik Olsen
12.09 – 30.09: Harald Gjøsæter

FF Johan Hjort

Byggeår: 1990
Størrelse: 1828 grt., 64,4 m
~ nettsiden om FF Johan Hjort

Toktleder

01.08 – 15.08: Jens Christian Holst
15.08 – 08.09: Kjell Nedraas
13.09 – 18.09: Randi Ingvaldsen

FF Jan Mayen

Byggeår: 1988
Eier: Universitetet i Tromsø
~ nettside om FF Jan Mayen

Toktleder

04.08 – 19.08: Ole Thomas Albert
12.09 – 25.09: Åge Høines